Η υδατοκαλλιέργεια περιλαμβάνει την ελεγχόμενη καλλιέργεια ψαριών, μαλακίων και καρκινοειδών με τέσσερις χώρες της Ευρωπαϊκής Ένωσης να αντιπροσώπευαν συλλογικά περίπου τα δύο τρίτα (68%) της συνολικής παραγωγής εκτρεφόμενων υδρόβιων οργανισμών το 2021: Ισπανία 25%, Γαλλία 17% και Ιταλία και Ελλάδα 13%. Ωστόσο, η παραγωγή εντός της Ευρωπαϊκής Ένωσης ήταν μικρότερη από εκείνη της Νορβηγίας, όπου παρήχθησαν 1,6 εκατομμύρια τόνοι υδρόβιων οργανισμών, το μεγαλύτερο μέρος των οποίων ήταν σολομός εκτροφής.
Υπάρχει υψηλός βαθμός εξειδίκευσης στην υδατοκαλλιέργεια εντός της Ευρωπαϊκής Ένωσης. Συγκεκριμένα η Ισπανία παρήγαγε περίπου 7 στους 10 τόνους εκτρεφόμενων μεσογειακών μυδιών της Ένωσης για το 2021, ενώ η Γαλλία εκμεταλλεύτηκε τα περισσότερα στρείδια (88% του συνόλου) και ήταν ο κύριος προμηθευτής των εκτρεφόμενων μπλε μυδιών της Ε.Ε (45% του συνόλου).
Η Ιταλία παρήγαγε τη συντριπτική πλειονότητα (92%) του εκτρεφόμενου ιαπωνικού κελύφους χελιού της ΕΕ. Η Ελλάδα παρήγαγε το μεγαλύτερο μέρος της εκτρεφόμενης τσιπούρας της ΕΕ (69% του συνόλου) και ευρωπαϊκού λαβράκι (53%). Ο εκτρεφόμενος ερυθρός τόνος του Ατλαντικού παρήχθη περισσότερο στη Μάλτα (72% του συνόλου της ΕΕ), ενώ η Ιρλανδία ήταν υπεύθυνη για το σύνολο σχεδόν του εκτρεφόμενου σολομού το 2021 (96%).
Το 2021, εκτιμάται ότι εκτρέφονταν 1,1 εκατομμύρια τόνοι υδρόβιων οργανισμών στην Ευρωπαϊκή Ένωση, αξίας 4,2 δισεκατομμυρίων ευρώ, σύμφωνα με στοιχεία της Eurostat που δόθηκαν σήμερα στη δημοσιότητα.
Η παραγωγή στην Ευρωπαϊκή Ένωση επικεντρώνεται κυρίως σε είδη όπως η πέστροφα, η τσιπούρα, το λαβράκι, ο κυπρίνος, ο τόνος, ο σολομός καθώς και στα μαλάκια (συμπεριλαμβανομένων των μυδιών, των στρειδιών και των αχιβάδων), τα οποία μαζί αντιπροσώπευαν σχεδόν το σύνολο της παραγωγής υδατοκαλλιέργειας κατά βάρος το 2021. Διαφορετικοί υδρόβιοι οργανισμοί έχουν διαφορετικές τιμές. Η αξία παραγωγής της πέστροφας και του λαβρακιού το 2021 ήταν υψηλότερη από άλλα είδη στην Ένωση (το καθένα αντιπροσώπευε μερίδιο 14% της συνολικής αξίας της υδροκαλλιέργειας της ΕΕ το 2021).
